Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BFSP2Q13515 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms