Protein–RNA interactions for Protein: Q13506

NAB1, NGFI-A-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAB1Q13506 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NAB1Q13506 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NAB1Q13506 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NAB1Q13506 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NAB1Q13506 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NAB1Q13506 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NAB1Q13506 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NAB1Q13506 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NAB1Q13506 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NAB1Q13506 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NAB1Q13506 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NAB1Q13506 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NAB1Q13506 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NAB1Q13506 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NAB1Q13506 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NAB1Q13506 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NAB1Q13506 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NAB1Q13506 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NAB1Q13506 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NAB1Q13506 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NAB1Q13506 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NAB1Q13506 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NAB1Q13506 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NAB1Q13506 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NAB1Q13506 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NAB1Q13506 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NAB1Q13506 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NAB1Q13506 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NAB1Q13506 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NAB1Q13506 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NAB1Q13506 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NAB1Q13506 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NAB1Q13506 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NAB1Q13506 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NAB1Q13506 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NAB1Q13506 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NAB1Q13506 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NAB1Q13506 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NAB1Q13506 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NAB1Q13506 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NAB1Q13506 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NAB1Q13506 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NAB1Q13506 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NAB1Q13506 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NAB1Q13506 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NAB1Q13506 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NAB1Q13506 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NAB1Q13506 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NAB1Q13506 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NAB1Q13506 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NAB1Q13506 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NAB1Q13506 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NAB1Q13506 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NAB1Q13506 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NAB1Q13506 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NAB1Q13506 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NAB1Q13506 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NAB1Q13506 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NAB1Q13506 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NAB1Q13506 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NAB1Q13506 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NAB1Q13506 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NAB1Q13506 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NAB1Q13506 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NAB1Q13506 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NAB1Q13506 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NAB1Q13506 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NAB1Q13506 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NAB1Q13506 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NAB1Q13506 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NAB1Q13506 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NAB1Q13506 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NAB1Q13506 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NAB1Q13506 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NAB1Q13506 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NAB1Q13506 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NAB1Q13506 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NAB1Q13506 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
NAB1Q13506 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NAB1Q13506 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NAB1Q13506 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NAB1Q13506 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NAB1Q13506 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NAB1Q13506 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NAB1Q13506 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NAB1Q13506 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NAB1Q13506 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NAB1Q13506 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NAB1Q13506 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NAB1Q13506 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
NAB1Q13506 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NAB1Q13506 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NAB1Q13506 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NAB1Q13506 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
NAB1Q13506 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NAB1Q13506 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NAB1Q13506 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NAB1Q13506 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NAB1Q13506 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NAB1Q13506 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms