Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
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