Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SKP2Q13309 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
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SKP2Q13309 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
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SKP2Q13309 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
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SKP2Q13309 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
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SKP2Q13309 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
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SKP2Q13309 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
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SKP2Q13309 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
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SKP2Q13309 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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SKP2Q13309 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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SKP2Q13309 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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