Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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