Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRDNQ13061 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TRDNQ13061 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
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