Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
HSPB3Q12988 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HSPB3Q12988 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HSPB3Q12988 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HSPB3Q12988 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HSPB3Q12988 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HSPB3Q12988 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HSPB3Q12988 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HSPB3Q12988 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HSPB3Q12988 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HSPB3Q12988 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HSPB3Q12988 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HSPB3Q12988 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HSPB3Q12988 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HSPB3Q12988 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HSPB3Q12988 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HSPB3Q12988 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HSPB3Q12988 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HSPB3Q12988 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HSPB3Q12988 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HSPB3Q12988 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HSPB3Q12988 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HSPB3Q12988 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HSPB3Q12988 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HSPB3Q12988 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HSPB3Q12988 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HSPB3Q12988 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HSPB3Q12988 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HSPB3Q12988 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HSPB3Q12988 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HSPB3Q12988 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HSPB3Q12988 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HSPB3Q12988 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HSPB3Q12988 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HSPB3Q12988 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HSPB3Q12988 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HSPB3Q12988 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HSPB3Q12988 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HSPB3Q12988 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HSPB3Q12988 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HSPB3Q12988 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HSPB3Q12988 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HSPB3Q12988 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HSPB3Q12988 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HSPB3Q12988 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HSPB3Q12988 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HSPB3Q12988 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HSPB3Q12988 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HSPB3Q12988 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HSPB3Q12988 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HSPB3Q12988 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HSPB3Q12988 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HSPB3Q12988 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HSPB3Q12988 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HSPB3Q12988 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HSPB3Q12988 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HSPB3Q12988 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HSPB3Q12988 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HSPB3Q12988 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HSPB3Q12988 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HSPB3Q12988 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HSPB3Q12988 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HSPB3Q12988 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HSPB3Q12988 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HSPB3Q12988 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HSPB3Q12988 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HSPB3Q12988 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HSPB3Q12988 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HSPB3Q12988 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HSPB3Q12988 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HSPB3Q12988 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HSPB3Q12988 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HSPB3Q12988 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HSPB3Q12988 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HSPB3Q12988 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HSPB3Q12988 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
HSPB3Q12988 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HSPB3Q12988 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HSPB3Q12988 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
HSPB3Q12988 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HSPB3Q12988 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HSPB3Q12988 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HSPB3Q12988 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HSPB3Q12988 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HSPB3Q12988 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HSPB3Q12988 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HSPB3Q12988 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
HSPB3Q12988 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HSPB3Q12988 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HSPB3Q12988 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HSPB3Q12988 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HSPB3Q12988 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HSPB3Q12988 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HSPB3Q12988 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HSPB3Q12988 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HSPB3Q12988 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HSPB3Q12988 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HSPB3Q12988 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
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