Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NFX1Q12986 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NFX1Q12986 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NFX1Q12986 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NFX1Q12986 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NFX1Q12986 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NFX1Q12986 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NFX1Q12986 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NFX1Q12986 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NFX1Q12986 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NFX1Q12986 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NFX1Q12986 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NFX1Q12986 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NFX1Q12986 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NFX1Q12986 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NFX1Q12986 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NFX1Q12986 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NFX1Q12986 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NFX1Q12986 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NFX1Q12986 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NFX1Q12986 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NFX1Q12986 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NFX1Q12986 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NFX1Q12986 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NFX1Q12986 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NFX1Q12986 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NFX1Q12986 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NFX1Q12986 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NFX1Q12986 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NFX1Q12986 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NFX1Q12986 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NFX1Q12986 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NFX1Q12986 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NFX1Q12986 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NFX1Q12986 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NFX1Q12986 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NFX1Q12986 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NFX1Q12986 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NFX1Q12986 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NFX1Q12986 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NFX1Q12986 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NFX1Q12986 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
NFX1Q12986 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NFX1Q12986 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NFX1Q12986 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NFX1Q12986 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NFX1Q12986 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NFX1Q12986 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NFX1Q12986 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NFX1Q12986 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NFX1Q12986 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NFX1Q12986 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NFX1Q12986 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NFX1Q12986 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NFX1Q12986 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NFX1Q12986 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NFX1Q12986 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NFX1Q12986 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NFX1Q12986 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NFX1Q12986 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NFX1Q12986 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NFX1Q12986 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NFX1Q12986 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NFX1Q12986 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NFX1Q12986 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NFX1Q12986 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NFX1Q12986 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
NFX1Q12986 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NFX1Q12986 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NFX1Q12986 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NFX1Q12986 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
NFX1Q12986 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NFX1Q12986 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NFX1Q12986 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NFX1Q12986 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NFX1Q12986 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NFX1Q12986 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NFX1Q12986 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NFX1Q12986 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NFX1Q12986 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NFX1Q12986 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NFX1Q12986 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
NFX1Q12986 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
NFX1Q12986 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NFX1Q12986 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NFX1Q12986 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NFX1Q12986 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NFX1Q12986 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
NFX1Q12986 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NFX1Q12986 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NFX1Q12986 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NFX1Q12986 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
NFX1Q12986 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NFX1Q12986 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NFX1Q12986 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NFX1Q12986 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NFX1Q12986 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NFX1Q12986 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NFX1Q12986 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NFX1Q12986 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
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