Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
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PTPRJQ12913 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
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PTPRJQ12913 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRJQ12913 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
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