Protein–RNA interactions for Protein: Q12908

SLC10A2, Ileal sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A2Q12908 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC10A2Q12908 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC10A2Q12908 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC10A2Q12908 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC10A2Q12908 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC10A2Q12908 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC10A2Q12908 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC10A2Q12908 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC10A2Q12908 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC10A2Q12908 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC10A2Q12908 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC10A2Q12908 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC10A2Q12908 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC10A2Q12908 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC10A2Q12908 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC10A2Q12908 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC10A2Q12908 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC10A2Q12908 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC10A2Q12908 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC10A2Q12908 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC10A2Q12908 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC10A2Q12908 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC10A2Q12908 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC10A2Q12908 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC10A2Q12908 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC10A2Q12908 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC10A2Q12908 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC10A2Q12908 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC10A2Q12908 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC10A2Q12908 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC10A2Q12908 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC10A2Q12908 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC10A2Q12908 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC10A2Q12908 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC10A2Q12908 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC10A2Q12908 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC10A2Q12908 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC10A2Q12908 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC10A2Q12908 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC10A2Q12908 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC10A2Q12908 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC10A2Q12908 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC10A2Q12908 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC10A2Q12908 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC10A2Q12908 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC10A2Q12908 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC10A2Q12908 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC10A2Q12908 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC10A2Q12908 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC10A2Q12908 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC10A2Q12908 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC10A2Q12908 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC10A2Q12908 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC10A2Q12908 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC10A2Q12908 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC10A2Q12908 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC10A2Q12908 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC10A2Q12908 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC10A2Q12908 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC10A2Q12908 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC10A2Q12908 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC10A2Q12908 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC10A2Q12908 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC10A2Q12908 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC10A2Q12908 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC10A2Q12908 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC10A2Q12908 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC10A2Q12908 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC10A2Q12908 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC10A2Q12908 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC10A2Q12908 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC10A2Q12908 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC10A2Q12908 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC10A2Q12908 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC10A2Q12908 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC10A2Q12908 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC10A2Q12908 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC10A2Q12908 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC10A2Q12908 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC10A2Q12908 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC10A2Q12908 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC10A2Q12908 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC10A2Q12908 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC10A2Q12908 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC10A2Q12908 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC10A2Q12908 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC10A2Q12908 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC10A2Q12908 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC10A2Q12908 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC10A2Q12908 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC10A2Q12908 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC10A2Q12908 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC10A2Q12908 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC10A2Q12908 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC10A2Q12908 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC10A2Q12908 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC10A2Q12908 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC10A2Q12908 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC10A2Q12908 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC10A2Q12908 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms