Protein–RNA interactions for Protein: Q10567

AP1B1, AP-1 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 949 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1B1Q10567 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
AP1B1Q10567 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
AP1B1Q10567 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
AP1B1Q10567 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
AP1B1Q10567 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
AP1B1Q10567 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
AP1B1Q10567 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
AP1B1Q10567 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
AP1B1Q10567 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
AP1B1Q10567 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
AP1B1Q10567 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
AP1B1Q10567 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
AP1B1Q10567 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
AP1B1Q10567 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
AP1B1Q10567 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
AP1B1Q10567 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
AP1B1Q10567 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
AP1B1Q10567 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
AP1B1Q10567 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
AP1B1Q10567 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
AP1B1Q10567 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
AP1B1Q10567 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
AP1B1Q10567 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
AP1B1Q10567 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
AP1B1Q10567 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
AP1B1Q10567 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
AP1B1Q10567 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
AP1B1Q10567 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
AP1B1Q10567 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
AP1B1Q10567 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
AP1B1Q10567 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
AP1B1Q10567 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
AP1B1Q10567 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
AP1B1Q10567 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
AP1B1Q10567 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
AP1B1Q10567 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
AP1B1Q10567 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
AP1B1Q10567 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
AP1B1Q10567 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
AP1B1Q10567 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
AP1B1Q10567 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
AP1B1Q10567 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
AP1B1Q10567 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
AP1B1Q10567 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
AP1B1Q10567 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
AP1B1Q10567 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
AP1B1Q10567 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
AP1B1Q10567 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
AP1B1Q10567 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
AP1B1Q10567 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
AP1B1Q10567 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
AP1B1Q10567 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
AP1B1Q10567 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
AP1B1Q10567 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
AP1B1Q10567 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
AP1B1Q10567 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
AP1B1Q10567 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
AP1B1Q10567 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
AP1B1Q10567 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
AP1B1Q10567 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
AP1B1Q10567 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
AP1B1Q10567 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
AP1B1Q10567 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
AP1B1Q10567 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
AP1B1Q10567 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
AP1B1Q10567 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
AP1B1Q10567 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
AP1B1Q10567 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
AP1B1Q10567 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
AP1B1Q10567 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
AP1B1Q10567 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
AP1B1Q10567 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
AP1B1Q10567 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
AP1B1Q10567 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
AP1B1Q10567 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
AP1B1Q10567 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
AP1B1Q10567 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
AP1B1Q10567 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
AP1B1Q10567 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
AP1B1Q10567 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
AP1B1Q10567 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
AP1B1Q10567 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
AP1B1Q10567 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
AP1B1Q10567 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
AP1B1Q10567 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
AP1B1Q10567 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
AP1B1Q10567 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
AP1B1Q10567 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
AP1B1Q10567 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
AP1B1Q10567 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
AP1B1Q10567 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
AP1B1Q10567 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
AP1B1Q10567 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
AP1B1Q10567 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
AP1B1Q10567 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
AP1B1Q10567 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
AP1B1Q10567 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
AP1B1Q10567 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
AP1B1Q10567 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
AP1B1Q10567 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms