Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NIPAL4Q0D2K0 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NIPAL4Q0D2K0 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NIPAL4Q0D2K0 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NIPAL4Q0D2K0 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
NIPAL4Q0D2K0 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NIPAL4Q0D2K0 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NIPAL4Q0D2K0 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NIPAL4Q0D2K0 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NIPAL4Q0D2K0 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NIPAL4Q0D2K0 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NIPAL4Q0D2K0 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NIPAL4Q0D2K0 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NIPAL4Q0D2K0 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
NIPAL4Q0D2K0 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NIPAL4Q0D2K0 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
NIPAL4Q0D2K0 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NIPAL4Q0D2K0 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NIPAL4Q0D2K0 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NIPAL4Q0D2K0 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
NIPAL4Q0D2K0 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NIPAL4Q0D2K0 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NIPAL4Q0D2K0 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NIPAL4Q0D2K0 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NIPAL4Q0D2K0 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NIPAL4Q0D2K0 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NIPAL4Q0D2K0 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
NIPAL4Q0D2K0 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NIPAL4Q0D2K0 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NIPAL4Q0D2K0 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NIPAL4Q0D2K0 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NIPAL4Q0D2K0 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NIPAL4Q0D2K0 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NIPAL4Q0D2K0 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NIPAL4Q0D2K0 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NIPAL4Q0D2K0 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NIPAL4Q0D2K0 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NIPAL4Q0D2K0 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
NIPAL4Q0D2K0 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NIPAL4Q0D2K0 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NIPAL4Q0D2K0 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NIPAL4Q0D2K0 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NIPAL4Q0D2K0 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NIPAL4Q0D2K0 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NIPAL4Q0D2K0 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
NIPAL4Q0D2K0 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NIPAL4Q0D2K0 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NIPAL4Q0D2K0 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NIPAL4Q0D2K0 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NIPAL4Q0D2K0 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NIPAL4Q0D2K0 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NIPAL4Q0D2K0 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NIPAL4Q0D2K0 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NIPAL4Q0D2K0 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NIPAL4Q0D2K0 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NIPAL4Q0D2K0 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NIPAL4Q0D2K0 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NIPAL4Q0D2K0 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NIPAL4Q0D2K0 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NIPAL4Q0D2K0 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NIPAL4Q0D2K0 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NIPAL4Q0D2K0 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
NIPAL4Q0D2K0 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NIPAL4Q0D2K0 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NIPAL4Q0D2K0 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NIPAL4Q0D2K0 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
NIPAL4Q0D2K0 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
NIPAL4Q0D2K0 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NIPAL4Q0D2K0 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NIPAL4Q0D2K0 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NIPAL4Q0D2K0 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NIPAL4Q0D2K0 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NIPAL4Q0D2K0 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NIPAL4Q0D2K0 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NIPAL4Q0D2K0 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NIPAL4Q0D2K0 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NIPAL4Q0D2K0 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NIPAL4Q0D2K0 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NIPAL4Q0D2K0 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NIPAL4Q0D2K0 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NIPAL4Q0D2K0 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms