Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms