Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CXCL9Q07325 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CXCL9Q07325 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CXCL9Q07325 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CXCL9Q07325 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CXCL9Q07325 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CXCL9Q07325 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CXCL9Q07325 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CXCL9Q07325 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CXCL9Q07325 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CXCL9Q07325 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CXCL9Q07325 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CXCL9Q07325 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CXCL9Q07325 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CXCL9Q07325 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CXCL9Q07325 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CXCL9Q07325 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CXCL9Q07325 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CXCL9Q07325 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CXCL9Q07325 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CXCL9Q07325 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CXCL9Q07325 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CXCL9Q07325 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CXCL9Q07325 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CXCL9Q07325 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CXCL9Q07325 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CXCL9Q07325 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CXCL9Q07325 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CXCL9Q07325 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CXCL9Q07325 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CXCL9Q07325 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CXCL9Q07325 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CXCL9Q07325 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CXCL9Q07325 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CXCL9Q07325 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CXCL9Q07325 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CXCL9Q07325 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CXCL9Q07325 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CXCL9Q07325 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CXCL9Q07325 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CXCL9Q07325 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CXCL9Q07325 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CXCL9Q07325 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CXCL9Q07325 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CXCL9Q07325 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CXCL9Q07325 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CXCL9Q07325 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CXCL9Q07325 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CXCL9Q07325 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CXCL9Q07325 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CXCL9Q07325 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CXCL9Q07325 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CXCL9Q07325 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CXCL9Q07325 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CXCL9Q07325 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CXCL9Q07325 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CXCL9Q07325 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CXCL9Q07325 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CXCL9Q07325 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CXCL9Q07325 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CXCL9Q07325 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CXCL9Q07325 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CXCL9Q07325 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CXCL9Q07325 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CXCL9Q07325 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CXCL9Q07325 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CXCL9Q07325 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CXCL9Q07325 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CXCL9Q07325 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CXCL9Q07325 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CXCL9Q07325 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CXCL9Q07325 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CXCL9Q07325 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CXCL9Q07325 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CXCL9Q07325 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CXCL9Q07325 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CXCL9Q07325 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CXCL9Q07325 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CXCL9Q07325 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CXCL9Q07325 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CXCL9Q07325 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CXCL9Q07325 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CXCL9Q07325 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CXCL9Q07325 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CXCL9Q07325 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CXCL9Q07325 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CXCL9Q07325 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CXCL9Q07325 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CXCL9Q07325 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CXCL9Q07325 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CXCL9Q07325 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CXCL9Q07325 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CXCL9Q07325 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CXCL9Q07325 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CXCL9Q07325 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CXCL9Q07325 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CXCL9Q07325 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CXCL9Q07325 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CXCL9Q07325 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CXCL9Q07325 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms