Protein–RNA interactions for Protein: Q04741

EMX1, Homeobox protein EMX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX1Q04741 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMX1Q04741 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms