Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms