Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
XPCQ01831 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
XPCQ01831 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
XPCQ01831 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
XPCQ01831 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
XPCQ01831 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
XPCQ01831 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
XPCQ01831 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
XPCQ01831 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
XPCQ01831 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
XPCQ01831 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
XPCQ01831 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
XPCQ01831 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
XPCQ01831 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
XPCQ01831 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
XPCQ01831 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
XPCQ01831 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
XPCQ01831 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
XPCQ01831 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
XPCQ01831 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
XPCQ01831 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
XPCQ01831 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
XPCQ01831 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
XPCQ01831 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
XPCQ01831 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
XPCQ01831 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
XPCQ01831 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
XPCQ01831 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
XPCQ01831 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
XPCQ01831 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
XPCQ01831 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
XPCQ01831 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
XPCQ01831 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
XPCQ01831 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
XPCQ01831 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
XPCQ01831 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
XPCQ01831 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
XPCQ01831 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
XPCQ01831 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
XPCQ01831 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
XPCQ01831 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
XPCQ01831 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
XPCQ01831 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
XPCQ01831 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
XPCQ01831 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
XPCQ01831 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
XPCQ01831 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
XPCQ01831 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
XPCQ01831 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
XPCQ01831 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
XPCQ01831 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
XPCQ01831 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
XPCQ01831 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
XPCQ01831 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
XPCQ01831 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
XPCQ01831 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
XPCQ01831 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
XPCQ01831 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
XPCQ01831 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
XPCQ01831 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
XPCQ01831 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
XPCQ01831 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
XPCQ01831 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
XPCQ01831 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
XPCQ01831 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
XPCQ01831 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
XPCQ01831 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
XPCQ01831 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
XPCQ01831 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
XPCQ01831 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
XPCQ01831 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
XPCQ01831 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
XPCQ01831 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
XPCQ01831 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
XPCQ01831 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
XPCQ01831 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
XPCQ01831 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
XPCQ01831 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
XPCQ01831 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
XPCQ01831 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
XPCQ01831 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
XPCQ01831 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
XPCQ01831 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
XPCQ01831 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
XPCQ01831 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
XPCQ01831 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
XPCQ01831 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
XPCQ01831 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
XPCQ01831 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
XPCQ01831 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
XPCQ01831 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
XPCQ01831 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
XPCQ01831 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
XPCQ01831 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
XPCQ01831 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
XPCQ01831 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
XPCQ01831 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
XPCQ01831 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
XPCQ01831 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
XPCQ01831 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms