Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms