Protein–RNA interactions for Protein: P84243

H3F3A, Histone H3.3, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3AP84243 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
H3F3AP84243 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H3F3AP84243 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
H3F3AP84243 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H3F3AP84243 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H3F3AP84243 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H3F3AP84243 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H3F3AP84243 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H3F3AP84243 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H3F3AP84243 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H3F3AP84243 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H3F3AP84243 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H3F3AP84243 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
H3F3AP84243 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
H3F3AP84243 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17■□□□□ 0.31
H3F3AP84243 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
H3F3AP84243 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
H3F3AP84243 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
H3F3AP84243 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17■□□□□ 0.31
H3F3AP84243 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H3F3AP84243 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H3F3AP84243 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H3F3AP84243 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H3F3AP84243 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
H3F3AP84243 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H3F3AP84243 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H3F3AP84243 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H3F3AP84243 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H3F3AP84243 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H3F3AP84243 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H3F3AP84243 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
H3F3AP84243 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
H3F3AP84243 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H3F3AP84243 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
H3F3AP84243 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
H3F3AP84243 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H3F3AP84243 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H3F3AP84243 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
H3F3AP84243 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
H3F3AP84243 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H3F3AP84243 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
H3F3AP84243 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H3F3AP84243 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H3F3AP84243 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
H3F3AP84243 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
H3F3AP84243 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
H3F3AP84243 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
H3F3AP84243 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
H3F3AP84243 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
H3F3AP84243 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
H3F3AP84243 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
H3F3AP84243 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
H3F3AP84243 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H3F3AP84243 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H3F3AP84243 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H3F3AP84243 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
H3F3AP84243 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
H3F3AP84243 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H3F3AP84243 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H3F3AP84243 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H3F3AP84243 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H3F3AP84243 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
H3F3AP84243 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
H3F3AP84243 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H3F3AP84243 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H3F3AP84243 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H3F3AP84243 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H3F3AP84243 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H3F3AP84243 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
H3F3AP84243 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H3F3AP84243 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H3F3AP84243 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
H3F3AP84243 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
H3F3AP84243 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H3F3AP84243 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
H3F3AP84243 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H3F3AP84243 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H3F3AP84243 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H3F3AP84243 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H3F3AP84243 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H3F3AP84243 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H3F3AP84243 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H3F3AP84243 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H3F3AP84243 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H3F3AP84243 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H3F3AP84243 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H3F3AP84243 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
H3F3AP84243 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H3F3AP84243 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H3F3AP84243 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H3F3AP84243 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
H3F3AP84243 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
H3F3AP84243 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
H3F3AP84243 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
H3F3AP84243 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
H3F3AP84243 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H3F3AP84243 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
H3F3AP84243 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H3F3AP84243 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H3F3AP84243 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms