Protein–RNA interactions for Protein: P80098

CCL7, C-C motif chemokine 7, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL7P80098 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCL7P80098 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCL7P80098 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCL7P80098 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CCL7P80098 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCL7P80098 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCL7P80098 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCL7P80098 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCL7P80098 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCL7P80098 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CCL7P80098 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCL7P80098 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCL7P80098 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCL7P80098 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCL7P80098 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCL7P80098 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCL7P80098 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCL7P80098 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CCL7P80098 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCL7P80098 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCL7P80098 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCL7P80098 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCL7P80098 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCL7P80098 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCL7P80098 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCL7P80098 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCL7P80098 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCL7P80098 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCL7P80098 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCL7P80098 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCL7P80098 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCL7P80098 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCL7P80098 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCL7P80098 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCL7P80098 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCL7P80098 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCL7P80098 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCL7P80098 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCL7P80098 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCL7P80098 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCL7P80098 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCL7P80098 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCL7P80098 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCL7P80098 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCL7P80098 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCL7P80098 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCL7P80098 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCL7P80098 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCL7P80098 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCL7P80098 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CCL7P80098 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCL7P80098 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCL7P80098 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCL7P80098 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCL7P80098 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCL7P80098 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCL7P80098 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCL7P80098 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCL7P80098 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCL7P80098 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCL7P80098 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCL7P80098 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCL7P80098 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCL7P80098 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CCL7P80098 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCL7P80098 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCL7P80098 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCL7P80098 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCL7P80098 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCL7P80098 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CCL7P80098 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCL7P80098 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCL7P80098 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCL7P80098 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCL7P80098 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CCL7P80098 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCL7P80098 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCL7P80098 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCL7P80098 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCL7P80098 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCL7P80098 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCL7P80098 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCL7P80098 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCL7P80098 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCL7P80098 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCL7P80098 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCL7P80098 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCL7P80098 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCL7P80098 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCL7P80098 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCL7P80098 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CCL7P80098 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCL7P80098 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCL7P80098 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCL7P80098 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCL7P80098 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCL7P80098 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCL7P80098 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCL7P80098 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCL7P80098 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms