Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKP1P63208 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKP1P63208 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKP1P63208 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SKP1P63208 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKP1P63208 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKP1P63208 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKP1P63208 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKP1P63208 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKP1P63208 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKP1P63208 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKP1P63208 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKP1P63208 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKP1P63208 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKP1P63208 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKP1P63208 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKP1P63208 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKP1P63208 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKP1P63208 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKP1P63208 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SKP1P63208 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKP1P63208 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKP1P63208 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKP1P63208 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKP1P63208 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKP1P63208 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKP1P63208 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKP1P63208 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKP1P63208 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKP1P63208 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKP1P63208 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKP1P63208 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SKP1P63208 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SKP1P63208 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SKP1P63208 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SKP1P63208 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SKP1P63208 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SKP1P63208 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SKP1P63208 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SKP1P63208 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SKP1P63208 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SKP1P63208 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SKP1P63208 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SKP1P63208 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SKP1P63208 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SKP1P63208 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SKP1P63208 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SKP1P63208 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SKP1P63208 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SKP1P63208 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SKP1P63208 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SKP1P63208 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SKP1P63208 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SKP1P63208 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SKP1P63208 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SKP1P63208 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SKP1P63208 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SKP1P63208 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SKP1P63208 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SKP1P63208 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SKP1P63208 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SKP1P63208 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SKP1P63208 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SKP1P63208 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SKP1P63208 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SKP1P63208 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SKP1P63208 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SKP1P63208 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SKP1P63208 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SKP1P63208 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SKP1P63208 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SKP1P63208 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SKP1P63208 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SKP1P63208 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SKP1P63208 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SKP1P63208 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SKP1P63208 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SKP1P63208 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SKP1P63208 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SKP1P63208 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SKP1P63208 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SKP1P63208 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SKP1P63208 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SKP1P63208 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SKP1P63208 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SKP1P63208 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SKP1P63208 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SKP1P63208 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SKP1P63208 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SKP1P63208 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SKP1P63208 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SKP1P63208 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SKP1P63208 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SKP1P63208 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SKP1P63208 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SKP1P63208 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SKP1P63208 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SKP1P63208 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SKP1P63208 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SKP1P63208 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms