Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HERVK_113P62684 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HERVK_113P62684 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms