Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms