Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms