Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms