Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms