Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AFDNP55196 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AFDNP55196 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AFDNP55196 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AFDNP55196 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AFDNP55196 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AFDNP55196 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AFDNP55196 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC24■■□□□ 1.43
AFDNP55196 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
AFDNP55196 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AFDNP55196 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AFDNP55196 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AFDNP55196 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AFDNP55196 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
AFDNP55196 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
AFDNP55196 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AFDNP55196 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
AFDNP55196 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AFDNP55196 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC24■■□□□ 1.43
AFDNP55196 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
AFDNP55196 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
AFDNP55196 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
AFDNP55196 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC24■■□□□ 1.43
AFDNP55196 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
AFDNP55196 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AFDNP55196 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AFDNP55196 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AFDNP55196 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AFDNP55196 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AFDNP55196 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AFDNP55196 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AFDNP55196 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AFDNP55196 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AFDNP55196 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AFDNP55196 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AFDNP55196 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AFDNP55196 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AFDNP55196 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AFDNP55196 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AFDNP55196 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AFDNP55196 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AFDNP55196 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AFDNP55196 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AFDNP55196 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AFDNP55196 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AFDNP55196 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AFDNP55196 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
AFDNP55196 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AFDNP55196 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AFDNP55196 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AFDNP55196 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AFDNP55196 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AFDNP55196 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AFDNP55196 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AFDNP55196 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AFDNP55196 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AFDNP55196 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AFDNP55196 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AFDNP55196 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AFDNP55196 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AFDNP55196 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AFDNP55196 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
AFDNP55196 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
AFDNP55196 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
AFDNP55196 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AFDNP55196 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
AFDNP55196 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
AFDNP55196 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AFDNP55196 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
AFDNP55196 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
AFDNP55196 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AFDNP55196 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AFDNP55196 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AFDNP55196 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AFDNP55196 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AFDNP55196 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AFDNP55196 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AFDNP55196 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AFDNP55196 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AFDNP55196 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AFDNP55196 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AFDNP55196 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AFDNP55196 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AFDNP55196 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AFDNP55196 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AFDNP55196 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AFDNP55196 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AFDNP55196 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AFDNP55196 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AFDNP55196 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AFDNP55196 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
AFDNP55196 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
AFDNP55196 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AFDNP55196 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AFDNP55196 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
AFDNP55196 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
AFDNP55196 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
AFDNP55196 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
AFDNP55196 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AFDNP55196 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms