Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms