Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AP3M2P53677 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
AP3M2P53677 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
AP3M2P53677 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
AP3M2P53677 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
AP3M2P53677 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
AP3M2P53677 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AP3M2P53677 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
AP3M2P53677 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AP3M2P53677 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AP3M2P53677 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AP3M2P53677 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AP3M2P53677 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AP3M2P53677 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AP3M2P53677 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
AP3M2P53677 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
AP3M2P53677 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
AP3M2P53677 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AP3M2P53677 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AP3M2P53677 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AP3M2P53677 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AP3M2P53677 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AP3M2P53677 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AP3M2P53677 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AP3M2P53677 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
AP3M2P53677 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
AP3M2P53677 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
AP3M2P53677 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AP3M2P53677 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AP3M2P53677 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
AP3M2P53677 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
AP3M2P53677 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AP3M2P53677 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
AP3M2P53677 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
AP3M2P53677 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
AP3M2P53677 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
AP3M2P53677 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AP3M2P53677 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AP3M2P53677 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AP3M2P53677 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
AP3M2P53677 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AP3M2P53677 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AP3M2P53677 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
AP3M2P53677 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
AP3M2P53677 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AP3M2P53677 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AP3M2P53677 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AP3M2P53677 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AP3M2P53677 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AP3M2P53677 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AP3M2P53677 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
AP3M2P53677 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
AP3M2P53677 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AP3M2P53677 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
AP3M2P53677 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
AP3M2P53677 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
AP3M2P53677 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AP3M2P53677 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AP3M2P53677 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
AP3M2P53677 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
AP3M2P53677 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
AP3M2P53677 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
AP3M2P53677 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
AP3M2P53677 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AP3M2P53677 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AP3M2P53677 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
AP3M2P53677 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AP3M2P53677 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AP3M2P53677 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
AP3M2P53677 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AP3M2P53677 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
AP3M2P53677 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
AP3M2P53677 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
AP3M2P53677 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AP3M2P53677 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AP3M2P53677 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AP3M2P53677 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AP3M2P53677 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
AP3M2P53677 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AP3M2P53677 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
AP3M2P53677 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
AP3M2P53677 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
AP3M2P53677 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AP3M2P53677 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AP3M2P53677 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AP3M2P53677 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
AP3M2P53677 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
AP3M2P53677 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
AP3M2P53677 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AP3M2P53677 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
AP3M2P53677 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AP3M2P53677 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
AP3M2P53677 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AP3M2P53677 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AP3M2P53677 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AP3M2P53677 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
AP3M2P53677 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AP3M2P53677 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
AP3M2P53677 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AP3M2P53677 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms