Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms