Protein–RNA interactions for Protein: P50895

BCAM, Basal cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAMP50895 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BCAMP50895 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
BCAMP50895 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BCAMP50895 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BCAMP50895 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BCAMP50895 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BCAMP50895 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BCAMP50895 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BCAMP50895 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BCAMP50895 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BCAMP50895 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BCAMP50895 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BCAMP50895 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BCAMP50895 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BCAMP50895 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
BCAMP50895 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BCAMP50895 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BCAMP50895 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BCAMP50895 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
BCAMP50895 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
BCAMP50895 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BCAMP50895 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BCAMP50895 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BCAMP50895 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BCAMP50895 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BCAMP50895 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BCAMP50895 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BCAMP50895 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BCAMP50895 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BCAMP50895 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BCAMP50895 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BCAMP50895 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BCAMP50895 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BCAMP50895 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BCAMP50895 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BCAMP50895 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BCAMP50895 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BCAMP50895 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
BCAMP50895 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
BCAMP50895 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BCAMP50895 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BCAMP50895 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BCAMP50895 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BCAMP50895 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BCAMP50895 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BCAMP50895 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BCAMP50895 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BCAMP50895 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BCAMP50895 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
BCAMP50895 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BCAMP50895 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BCAMP50895 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BCAMP50895 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BCAMP50895 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BCAMP50895 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BCAMP50895 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BCAMP50895 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BCAMP50895 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BCAMP50895 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BCAMP50895 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BCAMP50895 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BCAMP50895 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BCAMP50895 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BCAMP50895 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BCAMP50895 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
BCAMP50895 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BCAMP50895 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BCAMP50895 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
BCAMP50895 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BCAMP50895 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BCAMP50895 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BCAMP50895 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BCAMP50895 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BCAMP50895 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BCAMP50895 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BCAMP50895 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BCAMP50895 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BCAMP50895 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BCAMP50895 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BCAMP50895 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BCAMP50895 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BCAMP50895 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BCAMP50895 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BCAMP50895 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
BCAMP50895 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BCAMP50895 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BCAMP50895 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BCAMP50895 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BCAMP50895 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BCAMP50895 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BCAMP50895 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BCAMP50895 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BCAMP50895 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BCAMP50895 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BCAMP50895 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BCAMP50895 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BCAMP50895 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BCAMP50895 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BCAMP50895 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BCAMP50895 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms