Protein–RNA interactions for Protein: P49418

AMPH, Amphiphysin, humanhuman

Predictions only

Length 695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMPHP49418 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
AMPHP49418 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
AMPHP49418 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AMPHP49418 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AMPHP49418 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AMPHP49418 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
AMPHP49418 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
AMPHP49418 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
AMPHP49418 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
AMPHP49418 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AMPHP49418 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AMPHP49418 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
AMPHP49418 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AMPHP49418 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AMPHP49418 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AMPHP49418 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
AMPHP49418 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
AMPHP49418 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
AMPHP49418 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
AMPHP49418 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
AMPHP49418 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
AMPHP49418 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AMPHP49418 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
AMPHP49418 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
AMPHP49418 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
AMPHP49418 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
AMPHP49418 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
AMPHP49418 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
AMPHP49418 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
AMPHP49418 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AMPHP49418 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AMPHP49418 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AMPHP49418 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
AMPHP49418 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
AMPHP49418 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
AMPHP49418 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AMPHP49418 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
AMPHP49418 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AMPHP49418 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
AMPHP49418 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
AMPHP49418 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
AMPHP49418 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AMPHP49418 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AMPHP49418 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AMPHP49418 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
AMPHP49418 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AMPHP49418 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
AMPHP49418 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AMPHP49418 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
AMPHP49418 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
AMPHP49418 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AMPHP49418 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AMPHP49418 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AMPHP49418 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AMPHP49418 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AMPHP49418 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AMPHP49418 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AMPHP49418 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AMPHP49418 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AMPHP49418 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AMPHP49418 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AMPHP49418 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AMPHP49418 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AMPHP49418 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AMPHP49418 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AMPHP49418 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AMPHP49418 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AMPHP49418 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AMPHP49418 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AMPHP49418 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AMPHP49418 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AMPHP49418 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
AMPHP49418 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AMPHP49418 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AMPHP49418 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
AMPHP49418 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
AMPHP49418 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
AMPHP49418 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AMPHP49418 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AMPHP49418 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AMPHP49418 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AMPHP49418 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AMPHP49418 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AMPHP49418 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AMPHP49418 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AMPHP49418 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AMPHP49418 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AMPHP49418 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AMPHP49418 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AMPHP49418 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AMPHP49418 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AMPHP49418 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AMPHP49418 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AMPHP49418 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AMPHP49418 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
AMPHP49418 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AMPHP49418 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
AMPHP49418 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AMPHP49418 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AMPHP49418 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms