Protein–RNA interactions for Protein: P48751

SLC4A3, Anion exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A3P48751 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC4A3P48751 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC4A3P48751 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC4A3P48751 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC4A3P48751 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC4A3P48751 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC4A3P48751 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC4A3P48751 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC4A3P48751 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC4A3P48751 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC4A3P48751 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC4A3P48751 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC4A3P48751 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC4A3P48751 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC4A3P48751 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC4A3P48751 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC4A3P48751 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC4A3P48751 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC4A3P48751 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC4A3P48751 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC4A3P48751 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC4A3P48751 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC4A3P48751 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC4A3P48751 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC4A3P48751 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC4A3P48751 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC4A3P48751 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC4A3P48751 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC4A3P48751 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC4A3P48751 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC4A3P48751 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC4A3P48751 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC4A3P48751 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC4A3P48751 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC4A3P48751 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC4A3P48751 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC4A3P48751 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC4A3P48751 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC4A3P48751 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC4A3P48751 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC4A3P48751 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC4A3P48751 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC4A3P48751 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC4A3P48751 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC4A3P48751 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC4A3P48751 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC4A3P48751 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC4A3P48751 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC4A3P48751 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC4A3P48751 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC4A3P48751 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC4A3P48751 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC4A3P48751 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC4A3P48751 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC4A3P48751 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC4A3P48751 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC4A3P48751 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC4A3P48751 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC4A3P48751 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC4A3P48751 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC4A3P48751 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC4A3P48751 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC4A3P48751 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC4A3P48751 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC4A3P48751 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC4A3P48751 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC4A3P48751 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC4A3P48751 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC4A3P48751 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC4A3P48751 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC4A3P48751 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms