Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
RANGAP1P46060 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
RANGAP1P46060 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
RANGAP1P46060 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
RANGAP1P46060 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
RANGAP1P46060 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
RANGAP1P46060 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
RANGAP1P46060 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
RANGAP1P46060 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
RANGAP1P46060 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
RANGAP1P46060 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
RANGAP1P46060 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
RANGAP1P46060 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
RANGAP1P46060 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
RANGAP1P46060 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
RANGAP1P46060 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
RANGAP1P46060 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
RANGAP1P46060 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
RANGAP1P46060 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
RANGAP1P46060 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
RANGAP1P46060 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
RANGAP1P46060 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
RANGAP1P46060 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
RANGAP1P46060 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
RANGAP1P46060 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
RANGAP1P46060 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
RANGAP1P46060 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
RANGAP1P46060 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
RANGAP1P46060 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
RANGAP1P46060 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
RANGAP1P46060 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
RANGAP1P46060 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
RANGAP1P46060 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
RANGAP1P46060 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
RANGAP1P46060 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
RANGAP1P46060 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
RANGAP1P46060 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
RANGAP1P46060 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
RANGAP1P46060 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
RANGAP1P46060 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
RANGAP1P46060 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
RANGAP1P46060 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
RANGAP1P46060 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
RANGAP1P46060 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
RANGAP1P46060 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
RANGAP1P46060 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
RANGAP1P46060 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
RANGAP1P46060 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
RANGAP1P46060 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
RANGAP1P46060 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
RANGAP1P46060 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
RANGAP1P46060 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
RANGAP1P46060 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
RANGAP1P46060 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
RANGAP1P46060 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
RANGAP1P46060 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
RANGAP1P46060 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
RANGAP1P46060 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
RANGAP1P46060 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
RANGAP1P46060 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
RANGAP1P46060 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
RANGAP1P46060 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
RANGAP1P46060 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
RANGAP1P46060 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
RANGAP1P46060 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
RANGAP1P46060 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
RANGAP1P46060 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
RANGAP1P46060 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
RANGAP1P46060 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
RANGAP1P46060 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
RANGAP1P46060 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
RANGAP1P46060 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
RANGAP1P46060 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
RANGAP1P46060 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
RANGAP1P46060 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
RANGAP1P46060 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
RANGAP1P46060 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
RANGAP1P46060 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
RANGAP1P46060 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
RANGAP1P46060 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
RANGAP1P46060 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
RANGAP1P46060 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
RANGAP1P46060 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
RANGAP1P46060 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
RANGAP1P46060 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
RANGAP1P46060 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
RANGAP1P46060 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
RANGAP1P46060 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
RANGAP1P46060 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
RANGAP1P46060 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
RANGAP1P46060 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
RANGAP1P46060 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
RANGAP1P46060 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
RANGAP1P46060 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
RANGAP1P46060 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
RANGAP1P46060 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
RANGAP1P46060 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
RANGAP1P46060 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
RANGAP1P46060 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
RANGAP1P46060 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms