Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
MCAMP43121 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
MCAMP43121 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MCAMP43121 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MCAMP43121 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MCAMP43121 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MCAMP43121 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MCAMP43121 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MCAMP43121 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MCAMP43121 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MCAMP43121 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MCAMP43121 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MCAMP43121 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MCAMP43121 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MCAMP43121 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MCAMP43121 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MCAMP43121 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MCAMP43121 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
MCAMP43121 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
MCAMP43121 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
MCAMP43121 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MCAMP43121 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MCAMP43121 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MCAMP43121 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MCAMP43121 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCAMP43121 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCAMP43121 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCAMP43121 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCAMP43121 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCAMP43121 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCAMP43121 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCAMP43121 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCAMP43121 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCAMP43121 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCAMP43121 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCAMP43121 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MCAMP43121 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCAMP43121 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCAMP43121 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCAMP43121 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCAMP43121 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCAMP43121 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCAMP43121 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCAMP43121 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCAMP43121 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCAMP43121 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCAMP43121 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCAMP43121 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCAMP43121 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MCAMP43121 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCAMP43121 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCAMP43121 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCAMP43121 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCAMP43121 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCAMP43121 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCAMP43121 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCAMP43121 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCAMP43121 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCAMP43121 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCAMP43121 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MCAMP43121 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCAMP43121 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCAMP43121 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCAMP43121 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCAMP43121 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCAMP43121 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCAMP43121 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCAMP43121 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCAMP43121 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCAMP43121 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MCAMP43121 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCAMP43121 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCAMP43121 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCAMP43121 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCAMP43121 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCAMP43121 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCAMP43121 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCAMP43121 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MCAMP43121 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MCAMP43121 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCAMP43121 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCAMP43121 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCAMP43121 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCAMP43121 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCAMP43121 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCAMP43121 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCAMP43121 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCAMP43121 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCAMP43121 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCAMP43121 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCAMP43121 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCAMP43121 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCAMP43121 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCAMP43121 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCAMP43121 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCAMP43121 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCAMP43121 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCAMP43121 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCAMP43121 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCAMP43121 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms