Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIK1P39086 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIK1P39086 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIK1P39086 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIK1P39086 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIK1P39086 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIK1P39086 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIK1P39086 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIK1P39086 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIK1P39086 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIK1P39086 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIK1P39086 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIK1P39086 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIK1P39086 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIK1P39086 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIK1P39086 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIK1P39086 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIK1P39086 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIK1P39086 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIK1P39086 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIK1P39086 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIK1P39086 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIK1P39086 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIK1P39086 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms