Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms