Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms