Protein–RNA interactions for Protein: P35913

PDE6B, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6BP35913 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE6BP35913 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE6BP35913 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE6BP35913 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE6BP35913 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE6BP35913 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE6BP35913 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE6BP35913 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE6BP35913 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE6BP35913 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE6BP35913 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE6BP35913 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE6BP35913 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE6BP35913 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE6BP35913 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE6BP35913 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE6BP35913 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE6BP35913 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE6BP35913 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE6BP35913 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE6BP35913 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE6BP35913 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE6BP35913 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE6BP35913 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE6BP35913 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE6BP35913 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE6BP35913 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE6BP35913 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE6BP35913 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE6BP35913 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE6BP35913 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE6BP35913 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE6BP35913 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE6BP35913 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE6BP35913 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE6BP35913 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE6BP35913 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE6BP35913 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE6BP35913 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE6BP35913 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE6BP35913 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE6BP35913 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE6BP35913 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE6BP35913 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE6BP35913 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE6BP35913 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE6BP35913 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE6BP35913 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE6BP35913 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE6BP35913 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE6BP35913 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE6BP35913 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE6BP35913 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE6BP35913 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE6BP35913 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE6BP35913 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE6BP35913 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE6BP35913 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE6BP35913 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE6BP35913 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE6BP35913 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE6BP35913 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE6BP35913 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE6BP35913 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE6BP35913 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE6BP35913 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE6BP35913 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE6BP35913 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE6BP35913 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE6BP35913 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE6BP35913 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE6BP35913 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE6BP35913 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE6BP35913 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE6BP35913 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE6BP35913 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE6BP35913 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE6BP35913 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE6BP35913 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE6BP35913 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE6BP35913 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PDE6BP35913 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PDE6BP35913 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PDE6BP35913 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PDE6BP35913 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PDE6BP35913 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDE6BP35913 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDE6BP35913 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDE6BP35913 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDE6BP35913 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDE6BP35913 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDE6BP35913 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDE6BP35913 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDE6BP35913 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDE6BP35913 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDE6BP35913 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDE6BP35913 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDE6BP35913 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE6BP35913 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE6BP35913 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms