Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
OTX2P32243 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
OTX2P32243 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
OTX2P32243 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
OTX2P32243 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
OTX2P32243 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
OTX2P32243 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
OTX2P32243 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
OTX2P32243 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
OTX2P32243 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
OTX2P32243 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
OTX2P32243 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
OTX2P32243 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
OTX2P32243 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
OTX2P32243 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
OTX2P32243 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
OTX2P32243 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
OTX2P32243 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
OTX2P32243 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
OTX2P32243 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
OTX2P32243 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
OTX2P32243 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
OTX2P32243 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
OTX2P32243 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
OTX2P32243 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
OTX2P32243 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
OTX2P32243 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
OTX2P32243 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
OTX2P32243 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
OTX2P32243 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
OTX2P32243 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
OTX2P32243 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
OTX2P32243 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
OTX2P32243 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
OTX2P32243 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
OTX2P32243 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
OTX2P32243 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
OTX2P32243 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
OTX2P32243 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
OTX2P32243 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
OTX2P32243 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
OTX2P32243 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
OTX2P32243 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
OTX2P32243 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
OTX2P32243 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
OTX2P32243 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
OTX2P32243 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
OTX2P32243 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
OTX2P32243 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
OTX2P32243 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
OTX2P32243 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
OTX2P32243 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
OTX2P32243 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
OTX2P32243 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
OTX2P32243 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
OTX2P32243 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
OTX2P32243 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
OTX2P32243 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
OTX2P32243 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
OTX2P32243 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
OTX2P32243 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
OTX2P32243 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
OTX2P32243 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
OTX2P32243 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
OTX2P32243 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
OTX2P32243 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
OTX2P32243 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
OTX2P32243 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
OTX2P32243 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
OTX2P32243 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
OTX2P32243 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
OTX2P32243 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
OTX2P32243 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
OTX2P32243 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
OTX2P32243 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
OTX2P32243 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
OTX2P32243 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
OTX2P32243 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
OTX2P32243 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
OTX2P32243 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
OTX2P32243 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
OTX2P32243 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
OTX2P32243 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
OTX2P32243 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
OTX2P32243 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
OTX2P32243 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
OTX2P32243 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
OTX2P32243 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
OTX2P32243 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
OTX2P32243 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
OTX2P32243 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
OTX2P32243 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
OTX2P32243 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
OTX2P32243 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
OTX2P32243 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
OTX2P32243 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
OTX2P32243 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
OTX2P32243 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
OTX2P32243 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
OTX2P32243 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms