Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CPS1P31327 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CPS1P31327 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CPS1P31327 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CPS1P31327 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CPS1P31327 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CPS1P31327 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CPS1P31327 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CPS1P31327 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CPS1P31327 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CPS1P31327 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CPS1P31327 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CPS1P31327 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CPS1P31327 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CPS1P31327 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CPS1P31327 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CPS1P31327 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CPS1P31327 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CPS1P31327 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CPS1P31327 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CPS1P31327 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CPS1P31327 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CPS1P31327 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CPS1P31327 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CPS1P31327 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CPS1P31327 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CPS1P31327 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CPS1P31327 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CPS1P31327 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CPS1P31327 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CPS1P31327 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CPS1P31327 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CPS1P31327 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CPS1P31327 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CPS1P31327 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CPS1P31327 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CPS1P31327 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CPS1P31327 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CPS1P31327 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CPS1P31327 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CPS1P31327 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CPS1P31327 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CPS1P31327 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CPS1P31327 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CPS1P31327 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CPS1P31327 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CPS1P31327 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CPS1P31327 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CPS1P31327 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CPS1P31327 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CPS1P31327 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CPS1P31327 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CPS1P31327 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CPS1P31327 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CPS1P31327 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CPS1P31327 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CPS1P31327 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CPS1P31327 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CPS1P31327 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CPS1P31327 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CPS1P31327 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CPS1P31327 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CPS1P31327 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CPS1P31327 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CPS1P31327 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CPS1P31327 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CPS1P31327 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CPS1P31327 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CPS1P31327 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CPS1P31327 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CPS1P31327 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CPS1P31327 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CPS1P31327 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CPS1P31327 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CPS1P31327 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CPS1P31327 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CPS1P31327 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CPS1P31327 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CPS1P31327 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CPS1P31327 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CPS1P31327 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CPS1P31327 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CPS1P31327 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CPS1P31327 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CPS1P31327 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CPS1P31327 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CPS1P31327 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CPS1P31327 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CPS1P31327 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CPS1P31327 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CPS1P31327 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CPS1P31327 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CPS1P31327 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CPS1P31327 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CPS1P31327 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CPS1P31327 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CPS1P31327 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CPS1P31327 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CPS1P31327 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CPS1P31327 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms