Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GTF2E1P29083 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF2E1P29083 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms