Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GCAP28676 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GCAP28676 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
GCAP28676 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
GCAP28676 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GCAP28676 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
GCAP28676 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GCAP28676 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GCAP28676 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GCAP28676 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GCAP28676 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GCAP28676 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GCAP28676 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GCAP28676 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GCAP28676 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GCAP28676 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GCAP28676 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GCAP28676 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GCAP28676 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GCAP28676 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GCAP28676 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GCAP28676 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GCAP28676 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GCAP28676 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GCAP28676 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GCAP28676 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GCAP28676 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GCAP28676 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GCAP28676 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
GCAP28676 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GCAP28676 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GCAP28676 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GCAP28676 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GCAP28676 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
GCAP28676 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GCAP28676 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GCAP28676 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GCAP28676 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GCAP28676 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GCAP28676 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GCAP28676 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GCAP28676 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
GCAP28676 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GCAP28676 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
GCAP28676 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GCAP28676 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
GCAP28676 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GCAP28676 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
GCAP28676 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GCAP28676 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GCAP28676 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GCAP28676 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GCAP28676 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GCAP28676 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GCAP28676 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GCAP28676 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GCAP28676 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GCAP28676 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GCAP28676 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GCAP28676 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GCAP28676 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GCAP28676 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GCAP28676 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GCAP28676 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GCAP28676 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GCAP28676 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GCAP28676 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GCAP28676 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GCAP28676 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GCAP28676 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GCAP28676 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GCAP28676 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GCAP28676 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GCAP28676 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GCAP28676 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GCAP28676 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GCAP28676 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GCAP28676 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GCAP28676 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GCAP28676 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GCAP28676 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GCAP28676 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GCAP28676 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GCAP28676 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GCAP28676 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GCAP28676 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GCAP28676 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GCAP28676 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GCAP28676 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GCAP28676 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GCAP28676 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GCAP28676 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
GCAP28676 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GCAP28676 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GCAP28676 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GCAP28676 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GCAP28676 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GCAP28676 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GCAP28676 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GCAP28676 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms