Protein–RNA interactions for Protein: P28066

PSMA5, Proteasome subunit alpha type-5, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA5P28066 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMA5P28066 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMA5P28066 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMA5P28066 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMA5P28066 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMA5P28066 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMA5P28066 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMA5P28066 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMA5P28066 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMA5P28066 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMA5P28066 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMA5P28066 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMA5P28066 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMA5P28066 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMA5P28066 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMA5P28066 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMA5P28066 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMA5P28066 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMA5P28066 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMA5P28066 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMA5P28066 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMA5P28066 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMA5P28066 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMA5P28066 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMA5P28066 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMA5P28066 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMA5P28066 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMA5P28066 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMA5P28066 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMA5P28066 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMA5P28066 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMA5P28066 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMA5P28066 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMA5P28066 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMA5P28066 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMA5P28066 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMA5P28066 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMA5P28066 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMA5P28066 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMA5P28066 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMA5P28066 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMA5P28066 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMA5P28066 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMA5P28066 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMA5P28066 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMA5P28066 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMA5P28066 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMA5P28066 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMA5P28066 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMA5P28066 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMA5P28066 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMA5P28066 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMA5P28066 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMA5P28066 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMA5P28066 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMA5P28066 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMA5P28066 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMA5P28066 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMA5P28066 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMA5P28066 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMA5P28066 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMA5P28066 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMA5P28066 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMA5P28066 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMA5P28066 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMA5P28066 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMA5P28066 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMA5P28066 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMA5P28066 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMA5P28066 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMA5P28066 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMA5P28066 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMA5P28066 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMA5P28066 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMA5P28066 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMA5P28066 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMA5P28066 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMA5P28066 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMA5P28066 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMA5P28066 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMA5P28066 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMA5P28066 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMA5P28066 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMA5P28066 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMA5P28066 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMA5P28066 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMA5P28066 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMA5P28066 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMA5P28066 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMA5P28066 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMA5P28066 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMA5P28066 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMA5P28066 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMA5P28066 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMA5P28066 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMA5P28066 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMA5P28066 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMA5P28066 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMA5P28066 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMA5P28066 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms