Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMLP26374 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMLP26374 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMLP26374 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMLP26374 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMLP26374 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMLP26374 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMLP26374 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMLP26374 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMLP26374 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMLP26374 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMLP26374 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMLP26374 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMLP26374 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMLP26374 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMLP26374 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMLP26374 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMLP26374 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMLP26374 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMLP26374 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMLP26374 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMLP26374 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMLP26374 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMLP26374 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMLP26374 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMLP26374 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMLP26374 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMLP26374 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMLP26374 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMLP26374 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMLP26374 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMLP26374 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMLP26374 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMLP26374 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMLP26374 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMLP26374 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMLP26374 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMLP26374 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMLP26374 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMLP26374 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMLP26374 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMLP26374 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMLP26374 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMLP26374 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMLP26374 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMLP26374 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMLP26374 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMLP26374 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMLP26374 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMLP26374 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMLP26374 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMLP26374 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMLP26374 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMLP26374 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMLP26374 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMLP26374 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMLP26374 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMLP26374 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMLP26374 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMLP26374 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMLP26374 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMLP26374 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMLP26374 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMLP26374 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMLP26374 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMLP26374 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMLP26374 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMLP26374 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMLP26374 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMLP26374 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMLP26374 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMLP26374 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMLP26374 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMLP26374 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMLP26374 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMLP26374 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMLP26374 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMLP26374 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMLP26374 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMLP26374 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMLP26374 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMLP26374 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMLP26374 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMLP26374 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMLP26374 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHMLP26374 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHMLP26374 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHMLP26374 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CHMLP26374 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHMLP26374 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHMLP26374 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHMLP26374 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHMLP26374 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHMLP26374 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CHMLP26374 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHMLP26374 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CHMLP26374 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHMLP26374 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHMLP26374 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHMLP26374 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.2 ms