Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms