Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMO2P25791 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMO2P25791 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMO2P25791 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMO2P25791 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMO2P25791 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMO2P25791 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMO2P25791 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
LMO2P25791 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
LMO2P25791 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMO2P25791 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMO2P25791 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMO2P25791 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMO2P25791 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
LMO2P25791 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMO2P25791 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMO2P25791 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMO2P25791 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
LMO2P25791 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
LMO2P25791 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMO2P25791 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMO2P25791 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMO2P25791 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMO2P25791 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMO2P25791 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMO2P25791 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMO2P25791 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMO2P25791 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMO2P25791 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMO2P25791 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMO2P25791 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMO2P25791 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMO2P25791 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMO2P25791 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMO2P25791 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMO2P25791 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMO2P25791 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMO2P25791 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
LMO2P25791 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMO2P25791 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMO2P25791 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMO2P25791 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
LMO2P25791 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMO2P25791 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMO2P25791 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMO2P25791 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMO2P25791 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMO2P25791 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMO2P25791 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMO2P25791 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMO2P25791 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMO2P25791 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMO2P25791 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMO2P25791 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMO2P25791 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMO2P25791 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMO2P25791 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMO2P25791 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMO2P25791 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMO2P25791 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMO2P25791 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMO2P25791 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMO2P25791 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMO2P25791 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMO2P25791 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMO2P25791 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMO2P25791 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMO2P25791 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMO2P25791 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LMO2P25791 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMO2P25791 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMO2P25791 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMO2P25791 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMO2P25791 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMO2P25791 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMO2P25791 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMO2P25791 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMO2P25791 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMO2P25791 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMO2P25791 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMO2P25791 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMO2P25791 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMO2P25791 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMO2P25791 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMO2P25791 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMO2P25791 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMO2P25791 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMO2P25791 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMO2P25791 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMO2P25791 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LMO2P25791 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMO2P25791 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMO2P25791 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMO2P25791 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMO2P25791 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMO2P25791 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMO2P25791 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMO2P25791 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMO2P25791 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMO2P25791 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms