Protein–RNA interactions for Protein: P25789

PSMA4, Proteasome subunit alpha type-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4P25789 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PSMA4P25789 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
PSMA4P25789 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PSMA4P25789 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMA4P25789 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMA4P25789 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMA4P25789 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMA4P25789 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMA4P25789 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMA4P25789 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMA4P25789 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMA4P25789 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMA4P25789 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMA4P25789 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMA4P25789 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMA4P25789 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMA4P25789 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMA4P25789 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMA4P25789 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMA4P25789 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMA4P25789 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMA4P25789 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMA4P25789 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMA4P25789 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMA4P25789 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMA4P25789 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMA4P25789 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMA4P25789 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMA4P25789 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMA4P25789 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMA4P25789 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMA4P25789 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMA4P25789 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMA4P25789 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms