Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMA3P25788 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMA3P25788 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMA3P25788 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMA3P25788 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMA3P25788 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMA3P25788 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMA3P25788 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMA3P25788 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMA3P25788 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMA3P25788 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMA3P25788 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMA3P25788 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMA3P25788 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMA3P25788 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMA3P25788 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMA3P25788 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMA3P25788 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMA3P25788 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMA3P25788 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMA3P25788 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMA3P25788 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMA3P25788 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMA3P25788 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMA3P25788 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMA3P25788 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSMA3P25788 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSMA3P25788 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSMA3P25788 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSMA3P25788 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSMA3P25788 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSMA3P25788 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSMA3P25788 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSMA3P25788 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PSMA3P25788 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSMA3P25788 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSMA3P25788 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSMA3P25788 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSMA3P25788 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSMA3P25788 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSMA3P25788 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSMA3P25788 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSMA3P25788 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSMA3P25788 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSMA3P25788 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSMA3P25788 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSMA3P25788 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSMA3P25788 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSMA3P25788 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSMA3P25788 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSMA3P25788 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSMA3P25788 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSMA3P25788 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSMA3P25788 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSMA3P25788 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms