Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPREP23469 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPREP23469 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPREP23469 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPREP23469 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPREP23469 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPREP23469 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPREP23469 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPREP23469 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPREP23469 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPREP23469 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPREP23469 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPREP23469 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPREP23469 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPREP23469 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPREP23469 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPREP23469 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPREP23469 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPREP23469 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPREP23469 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPREP23469 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPREP23469 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPREP23469 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPREP23469 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPREP23469 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPREP23469 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPREP23469 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPREP23469 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPREP23469 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPREP23469 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPREP23469 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPREP23469 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPREP23469 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPREP23469 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPREP23469 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPREP23469 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPREP23469 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPREP23469 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPREP23469 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPREP23469 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPREP23469 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPREP23469 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPREP23469 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPREP23469 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPREP23469 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPREP23469 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPREP23469 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPREP23469 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPREP23469 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPREP23469 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPREP23469 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPREP23469 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPREP23469 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPREP23469 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPREP23469 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPREP23469 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPREP23469 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPREP23469 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPREP23469 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPREP23469 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPREP23469 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPREP23469 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPREP23469 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPREP23469 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPREP23469 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPREP23469 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPREP23469 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPREP23469 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPREP23469 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPREP23469 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPREP23469 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPREP23469 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPREP23469 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPREP23469 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPREP23469 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPREP23469 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPREP23469 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPREP23469 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPREP23469 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPREP23469 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPREP23469 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPREP23469 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPREP23469 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPREP23469 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPREP23469 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPREP23469 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPREP23469 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPREP23469 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPREP23469 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPREP23469 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPREP23469 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPREP23469 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPREP23469 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPREP23469 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPREP23469 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPREP23469 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPREP23469 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPREP23469 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPREP23469 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPREP23469 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
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